As amostras são coletadas através de swabs (cotonetes) de nasofaringe (nariz) e orofaringe (garganta).
Como a carga viral costuma ser mais alta na primeira semana da doença, o exame de RT-PCR deve ser realizado o mais precocemente possível, preferencialmente, entre o 3º e o 5º dia do início dos sintomas. Coletas realizadas muito precocemente ou tardiamente são passíveis de resultados indeterminados.
Não é necessário nenhum preparo especial.
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