As amostras são coletadas através de swab(cotonete) da nasofaringe (nariz)
Como a carga viral costuma ser mais alta na primeira semana da doença, o exame de RT-PCR deve ser realizado o mais precocemente possível, preferencialmente, entre o 3º e o 5º dia do início dos sintomas. Coletas realizadas muito precocemente ou tardiamente são passíveis de resultados indeterminados.
Não é necessário nenhum preparo especial.